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問(wèn)題：在沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)品的情況下，確定未知物質(zhì)結(jié)構(gòu)，，利用MassWorks 測(cè)定結(jié)果會(huì)不會(huì)與實(shí)際測(cè)的結(jié)果有更大的偏差?

回答：不會(huì)的!低分辨質(zhì)譜經(jīng)過(guò)MassWorks校正處理后的質(zhì)量準(zhǔn)確度提高了100倍，能夠測(cè)定至0.00x Da，再加上同位素峰形的譜圖準(zhǔn)確度的對(duì)比，MassWorks能幫助我們過(guò)濾掉99%以上的假陽(yáng)性結(jié)果，直觀地識(shí)別出準(zhǔn)確的分子式。在高分辨儀器上,過(guò)分的依賴質(zhì)量準(zhǔn)確度倒是很可能產(chǎn)生錯(cuò)誤的結(jié)果,而譜圖準(zhǔn)確度可以對(duì)錯(cuò)誤的結(jié)果提供診斷信息。

 

問(wèn)題：MassWorks只與安捷倫合作了嗎?還有其它公司嗎?

回答：目前MassWorks與安捷倫在GC/MS方面開展了合作, 在GC/MSD推出了獨(dú)特的質(zhì)量準(zhǔn)確度和譜圖準(zhǔn)確度兩項(xiàng)指標(biāo),外加AutoCal(自動(dòng)校正)功能和優(yōu)惠的打包捆綁價(jià)格, 以提升安捷倫GC/MS平臺(tái)的定性能力。

其它公司(Waters、Bruker四極桿質(zhì)譜、Shimadzu液質(zhì)、PerkinElmer四極桿氣質(zhì)、Thermo、Advion)雖沒(méi)有開展類似的合作，但是這些公司質(zhì)譜采集的數(shù)據(jù)能被MassWorks直接讀取和處理。在其它質(zhì)譜儀(如Bruker 公司TOF儀器和自制的質(zhì)譜儀)上獲取的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，只要是連續(xù)(continuum)或輪廓圖(profile mode)數(shù)據(jù),也能導(dǎo)入MassWorks處理。

 

問(wèn)題：MassWorks軟件是否適用于無(wú)機(jī)質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析?

回答：這個(gè)問(wèn)題提得好。由于無(wú)機(jī)離子的同位數(shù)信息更豐富多彩,如Fe, Hg, Ru等, 外加相互間的干擾較重,MassWorks中的校正和分析技術(shù)其實(shí)更適合于無(wú)機(jī)質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析。目前版本MassWorks可以通過(guò)數(shù)據(jù)的導(dǎo)入進(jìn)行無(wú)機(jī)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的處理和分析。

 

問(wèn)題：對(duì)于一些質(zhì)譜軟件，得到的只是數(shù)據(jù)，而不是譜圖，比如PE家的，MassWorks怎么實(shí)現(xiàn)其功能呢?

回答：PE公司平臺(tái)的四極桿氣質(zhì)MassWorks亦能直接讀取，數(shù)據(jù)處理方法與安捷倫等相似。其它平臺(tái)如TOF等只要能生成連續(xù)(continuum)或輪廓圖(profile mode)數(shù)據(jù),也能導(dǎo)入MassWorks處理。

 

問(wèn)題：譜圖準(zhǔn)確度是什么?能否詳細(xì)解釋？

回答：譜圖準(zhǔn)確度代表校正后的實(shí)驗(yàn)質(zhì)譜圖(含同位素分布,理想峰形和測(cè)量誤差)與理論質(zhì)譜圖(含同位素分布和理想峰形但不含測(cè)量誤差)之間的相似程度, 詳情請(qǐng)參見(jiàn)這篇<<分析化學(xué)>>的封面文章(全文免費(fèi)下載): http://www.cernobioscience.com/resources/ac100888b.pdf 。

擴(kuò)展閱讀：http://www.antpedia.com/news/90/n-106690.html[未知物鑒定：1ppm不夠，譜圖準(zhǔn)確度幫大忙]

 

問(wèn)題：如果需要校正，是每做一個(gè)低分辨數(shù)據(jù)就需要進(jìn)樣一個(gè)調(diào)諧液樣品嗎?

回答：對(duì)低分辨的液質(zhì)，一天做一次標(biāo)樣校正就足夠,只要質(zhì)譜的采集條件如掃描速度和質(zhì)量范圍等保持不變。由于質(zhì)譜和色譜的相對(duì)獨(dú)立, 一天一次標(biāo)樣可以通過(guò)外標(biāo)的形式以直接注入(infusion)或快速色譜來(lái)采集。對(duì)低分辨的氣質(zhì)特別是安捷倫的GC/MSD, 由于調(diào)諧液樣隨機(jī)帶有,方便調(diào)用,建議在每個(gè)樣品分離結(jié)束時(shí)先快速降溫(以免色譜柱上的材料流出形成干擾),再打開調(diào)諧液進(jìn)樣閥門1-2分鐘來(lái)采集MassWorks校正所需的(近似于內(nèi)標(biāo)的)標(biāo)樣數(shù)據(jù)。我們做過(guò)長(zhǎng)達(dá)3周的實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)在這類儀器上只要不調(diào)諧并保持質(zhì)譜的采集條件如掃描速度和質(zhì)量范圍等不變,儀器的飄移在0.00x之內(nèi),而譜圖準(zhǔn)確度不受影響。實(shí)驗(yàn)室的詳情請(qǐng)見(jiàn):

　　http://www.cernobioscience.com/resources/ASMS2008/RobustnessofFormulaDeterminationSingleQuadGC-MSThPE141.pdf

在高分辯儀器如TOF上,由于用的是未知物本身的單同位數(shù)峰(Monoisotope)只對(duì)峰形作自我校正(sCLIPS),無(wú)需任何標(biāo)樣。

 

問(wèn)題：峰型函數(shù)可以運(yùn)用到所有峰的校正嗎?

回答：峰形函數(shù)和質(zhì)量誤差與質(zhì)量范圍有關(guān),所以在低分辨儀器上要用能夠涵蓋質(zhì)量范圍的混標(biāo),如氣質(zhì)和液質(zhì)上用的調(diào)諧液。在高分辯儀器如TOF上,由于用的是未知物本身的單同位數(shù)峰(Monoisotope)只對(duì)峰形作自我校正(sCLIPS), 每個(gè)離子都是單獨(dú)不同分別校正的。

 

問(wèn)題：在島津軟件能否用massworks軟件?

回答：島津公司的GC/MS不能使用MassWorks軟件，因?yàn)閸u津GC/MS工作站不能采集原始數(shù)據(jù)(continuum 或profile數(shù)據(jù))。

島津四極桿液質(zhì)(單四極桿和三重四極桿)可以使用，MassWorks能支持直接讀取。IT-TOF數(shù)據(jù)也能被MassWorks分析，只需將要分析的目標(biāo)峰的質(zhì)譜圖導(dǎo)入至MassWorks即可。

 

問(wèn)題：用氣質(zhì)做大氣污染源監(jiān)測(cè)時(shí)，由于污染源成分復(fù)雜，MassWorks能否幫我們的單四極桿氣質(zhì)做到定性與定量?如何定量?

回答：只有這些復(fù)雜的成分在下述情況下

　　(1) 色譜上不能分離時(shí)(即共流出), 其相關(guān)離子的質(zhì)譜峰不相互重疊

　　(2) 其相關(guān)離子的質(zhì)譜峰相互重疊時(shí), 色譜上能以保留時(shí)間分離

　　MassWorks則能有效使用。我們有不少用戶將MassWorks用于大氣污染物中未知成分的鑒定和有害物質(zhì)的確證分析。只有在色譜上不能分離(即共流出)的同時(shí)相關(guān)離子的質(zhì)譜峰又相互重疊的雙重條件下, MassWorks才會(huì)因干擾而會(huì)通過(guò)很差的譜圖準(zhǔn)確度告訴用戶有干擾的存在。

MassWorks暫不能用于定量分析。

 

問(wèn)題：對(duì)蛋白質(zhì)組研究來(lái)說(shuō)，主要是肽段、氨基酸片段測(cè)量，不知道MassWorks種矯正方法能否用在復(fù)雜樣品測(cè)序中?

回答：基本原理很適用但目前的版本暫不能做大分子的測(cè)序而只能作已知大分子的降解或轉(zhuǎn)化定量分析,如deamidation 或 deamination。

可以參考：http://songlyricspoint.com/news/n_id-326.html利用MassWorks譜圖準(zhǔn)確度定量脫酰胺基肽的含量

 

問(wèn)題：MassWorks現(xiàn)在能支持安捷倫7000C的MassHunter采集時(shí)的自動(dòng)校正嗎?

回答：MassWorks能支持這類儀器的數(shù)據(jù)直讀,但暫不能象GC/MSD那樣進(jìn)行AutoCal (自動(dòng)校正) 。

 

問(wèn)題：MassWorks用于液質(zhì)時(shí)，推薦使用什么物質(zhì)作為校準(zhǔn)物質(zhì)?

回答：可用Agilent公司的調(diào)諧液,也可自配小分子藥物的混標(biāo)。

 

問(wèn)題：我們實(shí)驗(yàn)室做液質(zhì)校準(zhǔn)時(shí)，用氯霉素來(lái)做校準(zhǔn)物質(zhì)，效果不太好，請(qǐng)問(wèn)會(huì)是什么問(wèn)題呢?

回答：請(qǐng)將具體數(shù)據(jù)與綠綿科技的李斌工程師共享，我們共同找出具體的原因和解決辦法。

 

問(wèn)題：MassWorks是所有的元素的同位素都可以計(jì)算嗎?

回答：是的，含元素周期表中所有的元素。

 

問(wèn)題：MassWorks對(duì)數(shù)據(jù)的量有要求嗎?0.1AMU/點(diǎn)就可以嗎?

回答：MassWorks要求采集的閾值必須為0，采集步長(zhǎng)0.1u就可以了。

 

問(wèn)題：目前有免費(fèi)開源的做譜圖校正的軟件嗎，性能與massworks的差距有多大?

回答：沒(méi)有類似開源軟件,因我們有多處的保護(hù)。

 

問(wèn)題：MassWorks是如何通過(guò)譜圖與理論譜圖的差異，預(yù)測(cè)化合物的C可能在4-15之間呢?

回答：Since the ¹³C relative abundance is roughly 1% and a typical A+1 isotope is dominated by ¹³C with smaller contributions from other higher isotopes such as ¹⁵N, ³³S, ²H etc., the A+1 isotope peak intensity (relative to the monoisotope peak intensity) is a good indicator for the number of carbon atoms contained in a given ion. For example, for an ion containing 10 carbons, the A+1 relative intensity should be around 10%. Therefore, a candidate formula with only 4 carbons would have its A+1 isotope significantly lower than the 10% observed in actual data while a formula with 15 carbons would have its A+1 isotope significantly higher than the 10% observed, indicating that the correct carbon number should be between 4 and 15.

 

問(wèn)題：用MassWorks是不是需要逐一分析每個(gè)化合物? 能否提供終匹配度高的報(bào)告?

回答：所有化合物的準(zhǔn)確質(zhì)量數(shù)據(jù)在校正完成后一次性獲得，但是元素組成的分析需要逐一分析感興趣的組分。MassWorks會(huì)根據(jù)譜圖準(zhǔn)確度和質(zhì)量準(zhǔn)確給出分子式分析結(jié)果，譜圖準(zhǔn)確度高的分子式位于結(jié)果的位，分子式分析結(jié)果包括理論質(zhì)量、質(zhì)量誤差、譜圖準(zhǔn)確度、不飽和度等非常實(shí)用的信息。

 

問(wèn)題：這個(gè)軟件可否用于分析預(yù)測(cè)未知化合物的分子式?

回答：可以!MassWorks的功能就是得到化合物的分子式，類似于高分辨質(zhì)譜，對(duì)譜庫(kù)中沒(méi)有的那種未知化合物, MassWorks是一種強(qiáng)有力的定性工具。

 

問(wèn)題：MassWorks如何用于AB Sciex QTRAP的數(shù)據(jù)?

回答：MassWorks使用方法與安捷倫氣質(zhì)類似，校正標(biāo)樣可以采用您實(shí)驗(yàn)室的任何標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。標(biāo)物和實(shí)際樣品可以在同一次運(yùn)行中采集做內(nèi)標(biāo)校正(可能會(huì)有相互干擾)，也可以分開采集標(biāo)物和實(shí)際樣品的數(shù)據(jù)做外標(biāo)校正(可避免相互干擾)。

 

問(wèn)題：MassWorks用于液質(zhì)和氣質(zhì)上有區(qū)別嗎?

回答：MassWorks液質(zhì)和氣質(zhì)的結(jié)果本質(zhì)上沒(méi)有區(qū)別!只是由于氣質(zhì)儀器上帶有調(diào)諧液，使用起來(lái)比液質(zhì)方便。

 

問(wèn)題：MassWorks與高分辨質(zhì)譜相比,在未知物結(jié)構(gòu)鑒定中是否也具有使用的意義?

　　比如說(shuō)在譜庫(kù)中沒(méi)有標(biāo)準(zhǔn)譜圖的前提下，MassWorks是否也可以通過(guò)分析得到未知物質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)?

回答：MassWorks能提供目標(biāo)化合物的分子離子、碎片離子的準(zhǔn)確質(zhì)量信息及它們準(zhǔn)確的元素組成，目前MassWorks還不能直接得到結(jié)構(gòu)。對(duì)于結(jié)構(gòu)分析，只能是通過(guò)分子離子和碎片離子的元素組成做人工推測(cè)。高分辨質(zhì)譜得到的結(jié)果也是這樣，目前還沒(méi)有一款真正有效的結(jié)構(gòu)解析軟件。

 

問(wèn)題：MassWorks能用于安捷倫6550Q-TOF上嗎?

回答：可以!用途在于通過(guò)譜圖準(zhǔn)確度來(lái)進(jìn)一步提升分子式確定的準(zhǔn)確性。詳情請(qǐng)見(jiàn)這篇在Orbitrap上的應(yīng)用文章: http://dx.doi.org/10.1016/j.jasms.2009.07.014 。

 

問(wèn)題：GCMS分析樣品時(shí)，是否要加入標(biāo)樣開啟和關(guān)閉步驟呢?這里說(shuō)的標(biāo)樣是說(shuō)GCMS的調(diào)諧樣品嗎?

回答：正確!建議在每個(gè)樣品分離結(jié)束時(shí)先快速降溫(以免色譜柱上的材料流出形成干擾),再打開調(diào)諧液進(jìn)樣閥門1-2分鐘來(lái)采集MassWorks校正所需的(近似于內(nèi)標(biāo)的)標(biāo)樣數(shù)據(jù)。

 

問(wèn)題：從色譜的共流出化合物會(huì)同時(shí)進(jìn)入質(zhì)譜，他們的質(zhì)譜峰將會(huì)重疊，如何分開重疊的峰?

回答：在下述情況

　　(1) 色譜上不能分離時(shí)(即共流出), 如其相關(guān)離子的質(zhì)譜峰不相互重疊;或者

　　(2) 其相關(guān)離子的質(zhì)譜峰相互重疊時(shí), 色譜上能以保留時(shí)間分離

MassWorks則能有效使用。只有在色譜上不能分離(即共流出)的同時(shí)相關(guān)離子的質(zhì)譜峰(只有幾個(gè)AMU的范圍內(nèi))又相互重疊的雙重條件下, MassWorks才會(huì)因干擾而會(huì)通過(guò)很差的譜圖準(zhǔn)確度告訴用戶有干擾的存在。

 

問(wèn)題：在實(shí)際分析中，比如說(shuō)GC-MS，GC的流出物源源不斷的流入質(zhì)譜，如果采用EI源，待測(cè)物的碎片峰將混在一起，如何提取每一種分析物的純凈質(zhì)譜圖呢? NIST退卷積主要是采用模型峰的方法，在您的軟件里如何處理的呢?

回答：MassWorks在這方面暫時(shí)還沒(méi)有處理辦法。

 

問(wèn)題：MassWorks在藥代方面有什么應(yīng)用?

回答：MassWorks在這方面的應(yīng)用有用于¹⁴C取代的混合物分析。

 

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