飛行時(shí)間質(zhì)譜(TOF)上利用譜圖準(zhǔn)確度來鑒定化合物的分子式
之前的幾期文章中,我們介紹了譜圖準(zhǔn)確度在質(zhì)譜上鑒定化合物分子式的作用,今天我們以飛行時(shí)間質(zhì)譜TOF為例,簡單描述譜圖準(zhǔn)確度對于化合物分子式鑒定的幫助。
26種化合物(見表1),最小的m/z為236,最大的m/z 1663,將這些化合物按分子量大小分成三組,第一組的八個(gè)化合物m/z <300,第二組的八個(gè)化合物300<m/z <400,第三組的10個(gè)化合物m/z>400。在AB Sciex 5600 Q-TOF上采集這些化合物的數(shù)據(jù),在MassWorks軟件中進(jìn)行譜圖準(zhǔn)確度和分子式分析。
表1:26種化合物的名稱、元素組成及理論精確質(zhì)量
(數(shù)據(jù)來源:Rapid Commun. Mass Spectrom.2012, 26, 1014–1022)
在MassWorks軟件中,利用sCLIPS功能對這些化合物的精確分子量進(jìn)行分子式分析,元素組成設(shè)定條件為 C(1–100)、H(0–200)、N(0–50)、O(0–50)、F(0–5)、S(0–5)、Cl(0–5)Br(0–5),質(zhì)量誤差范圍為±5ppm。MassWorks軟件測定的全部26個(gè)化合物的同位素譜圖準(zhǔn)確度結(jié)果見表2。全部26種化合物的譜圖準(zhǔn)確度均大于97%。
表2:MassWorks對26種化合物的同位素譜圖準(zhǔn)確度的測定結(jié)果
(數(shù)據(jù)來源:Rapid Commun. Mass Spectrom.2012, 26, 1014–1022)
表3的顯示了譜圖準(zhǔn)確度對這些化合物分子式的鑒定效果,從結(jié)果可以看出,m/z < 400的兩組化合物,譜圖準(zhǔn)確度都能準(zhǔn)確地將它們的分子式排在所有待選分子式的第一位,例如:Diclofenac,在5ppm的誤差范圍內(nèi),共有38個(gè)待選分子式,如果只是看精確質(zhì)量誤差,正確的分子式排在了第15位,而譜圖準(zhǔn)確度則將正確的分子式排在第一位。
表3:26種化合物的分子式排序結(jié)果:按譜圖準(zhǔn)確度或質(zhì)量誤差(N為待選分子式個(gè)數(shù))
(數(shù)據(jù)來源:Rapid Commun. Mass Spectrom.2012, 26, 1014–1022)
在m/z > 400的化合物分組中,盡管譜圖準(zhǔn)確度并不總是將正確的分子式排在第一位,但是它依然表現(xiàn)出了強(qiáng)大的分子式鑒定能力。如Trolitazone、Ketoconazole、Itraconazole、Thiostrepton這四個(gè)化合物,在不同的數(shù)據(jù)測量中,由于譜圖的輕微變化,會(huì)導(dǎo)致譜圖準(zhǔn)確度的細(xì)微變化,從而影響分子式的排名,但從效果上看,這幾個(gè)化合物的待選分子式的數(shù)量非常龐大,最少的有162個(gè)分子式,最多的有7491個(gè)分子式,譜圖準(zhǔn)確度始終都能將這幾個(gè)正確的分子式鎖定在前幾名,排除了99%以上的分子式,且分子式的鑒定結(jié)果遠(yuǎn)比按質(zhì)量誤差排序來的準(zhǔn)確得多。
結(jié)論
1)對于m/z < 400 Da的化合物,譜圖準(zhǔn)確度能將目標(biāo)分子式排在最高位置,對于m/z > 400的化合物,譜圖準(zhǔn)確度依然能將準(zhǔn)確的分子式排在幾百或數(shù)千個(gè)待選中的前幾名。2)譜圖準(zhǔn)確度+質(zhì)量精度的組合,是未知物分子式鑒定的最佳搭檔,通過在現(xiàn)有質(zhì)譜上獲得高的譜圖準(zhǔn)確度,能幫助我們在分子式的鑒定分析節(jié)省大量的驗(yàn)證工作。3)未知化合物的分子式(元素組成)測定是一項(xiàng)非常有挑戰(zhàn)的任務(wù),在高質(zhì)量精度的飛行時(shí)間質(zhì)譜TOF上,譜圖準(zhǔn)確度將是一個(gè)強(qiáng)大的分子式鑒定的輔助工具。
關(guān)于MassWorks
軟件MassWorks軟件是由 Cerno Bioscience 公司開發(fā)的一款革命性的MS數(shù)據(jù)定性分析軟件,能幫助我們在低分辨率的四極桿GC/MS、LC/MS直接測定化合物的精確質(zhì)量,并通過獨(dú)有的譜圖準(zhǔn)確度概念確定出準(zhǔn)確的分子式。MassWorks軟件同樣適用于高分率質(zhì)譜(TOF、Orbitrap)的定性分析。
關(guān)于綠綿科技
綠綿科技是Cerno Bioscience公司在中國區(qū)的總代理商,負(fù)責(zé)Cerno公司旗下的MassWorks、GC/ID 等產(chǎn)品市場推廣、銷售、售前/售后技術(shù)支持、應(yīng)用支持。若您想了解獲取 MassWorks 產(chǎn)品的更多信息或應(yīng)用,歡迎致電綠綿科技!
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北京綠綿科技有限公司(簡稱:綠綿科技)以體現(xiàn)客戶服務(wù)價(jià)值為宗旨,以專業(yè)精神和技能為廣大實(shí)驗(yàn)室分析工作者提供樣品前處理、樣品制備及分析、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)精確分析和管理的全面解決方案,致力于協(xié)助客戶提高分析檢測的效率和水平。主要代理產(chǎn)品聯(lián)系電話:010-82676061/2/3/4/5/6/7/8
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